坚持保护优先、规范利用、严格管理的原则，此次拟提请人大常委会审议的野生动物保护法修订草案二审稿作以下主要修改：一是细化野生动物保护制度措施。包括：完善保护名录调整机制、扩大应急救助野生动物的范围、发挥社会组织在野生动物收容救助中的积极作用；明确将野生动物保护重要栖息地纳入国家公园等自然保护地进行保护；增加违法使用禁用工具和方法猎捕野生动物的法律责任。二是与全国人大常委会关于全面禁食野生动物的规定相衔接，加大对违法行为的处罚力度。
这次修改野生动物保护法坚持问题导向，对近年社会关注的有关问题都作了回应，比如对于野猪伤人毁坏庄稼等问题，修订草案二审稿健全野生动物致害防控机制。包括：要求地方政府采取种群调控、建设隔离防护设施等措施，预防控制野生动物可能造成的危害；将中央财政对野生动物致害的预防控制及致害补偿的经费补助范围，从国家重点保护野生动物扩大到其他致害严重的陆生野生动物；明确在危及人身安全的紧急情况下，采取适当措施造成野生动物损害的，依法不承担法律责任。
对于动物园中的动物逃脱问题，修订草案二审稿规定，人工繁育野生动物应当采取必要的安全措施，防止野生动物伤人和逃逸。因野生动物伤人和逃逸造成损害的，应当依法承担法律责任。对随意放生野生动物现象，修订草案二审稿在2015年修改野生动物保护法增加专门规定的基础上进一步要求，授权野生动物保护主管部门制定野生动物放生的具体管理办法。对于社会关注的买卖鹦鹉的问题，修订草案二审稿明确将相关国际公约名录中的野生动物，按照本法有关规定进行管理，而不是按照修法之前的都按照国家重点保护野生动物进行管理。
此外，修订草案二审稿规定，建立人工繁育野生动物分类分级管理制度。对人工繁育国家重点保护野生动物实行许可管理，对人工繁育“三有”动物实行备案管理。同时明确应当区分情况，将相关国际公约名录中的野生动物，按照本法有关规定进行管理，而不是都按照国家重点保护野生动物进行管理。